Suurin erillinen ja samalla vanhin esinekokoelma Lustossa on Helsingin yliopiston maatalous-metsätieteellisen tiedekunnan metsämuseokokoelma. Näistä noin 1200 esineestä vanhimmat ovat peräisin vuonna 1862 perustetun Evon metsäopiston opetuskokoelmista, kuten esimerkiksi vanhat saksalaisvalmisteiset metsänhoitovälineet, monet pienoismallit ja A. G. Blomqvistin keräämät näytteet venäläisten kansojen punontatöistä.
Korkeimman metsäopetuksen siirtyessä 1908 Keisarilliseen Aleksanterin yliopistoon myös Evon opetuskokoelmat siirrettiin Helsinkiin. Metsätalon valmistuttua 1939 edelleen karttuneista kokoelmista muodostettiin maatalous-metsätieteellisen tiedekunnan metsämuseo, jolle oli rakennettu oma kokoelmahuoneensa.Tilanpuutteen takia kokoelma joutui varastoon 1970-luvulla.
Vuonna 1993 yliopiston metsämuseokokoelma siirrettiin Lustoon, jossa sen arvokkaita suomalaisen metsätalouden historiasta kertovia esineitä on ollut esillä useissa eri näyttelyissä.