Metsähistorian Seura toimii yhteistyössä koti- ja ulkomaisten historia- ja perinneyhdistysten sekä muiden metsähistoriasta kiinnostuneiden yhteisöjen kanssa. Jäsentensä kautta Seuralla on toimivat suhteet yliopistoihin, tutkimuslaitoksiin ja metsäalan organisaatioihin.
Seura toimii aktiivisesti Pohjoismaiden metsähistorian seurojen ja metsämuseoiden yhteistyöryhmässä. Yhteistyöryhmän puheenjohtajana toimi vuosina 2002-2009 Markku Rauhalahti. Pohjoismainen metsähistoriakonferenssi järjestettiin vuonna 2006 Suomessa, vuonna 2007 Islannissa, vuonna 2008 Tanskassa, vuonna 2009 Norjassa ja vuonna 2010 Ruotsissa. Vuonna 2011 konferenssi järjestetään taas Suomessa (katso ohjelma!).
Metsähistorian Seura on Tieteellisten Seurojen Valtuuskunnan ja Suomen Metsäyhdistyksen jäsen.
Metsähistorian Seura toimii kiinteässä yhteistyössä Suomen Metsämuseo Luston kanssa.
(23.1.2011)